O Programa CIP tem como meta reduzir o risco de infestação por pragas (insetos, aracnídeos, roedores, pássaros, etc.) e ao mesmo tempo minimizar o uso de praguicidas, através da adoção de medidas preventivas. Visto como um programa de melhoria contínua, seus métodos aplicados na prevenção de pragas são também importantes elementos de programas de BPF – Boas Práticas de Fabricação e APPCC – Analises de Perigos e Pontos Críticos de Controle, para a prevenção de contaminação microbiológica e de materiais estranhos, além de orientar sobre medidas e princípios sanitários, limpeza, organização e exclusão para prevenir atrativos, abrigo e acesso às pragas as áreas internas de processo ou armazenamento.